Точки расположения мококо указаны на картинке. При входе на уровень персонаж появляется в одной из 15-ти случайных точек (отмечены серыми квадратиками).
Голубыми и красными точками отмечено расположение NPC. Розовым отмечены кратчайшие пути для выполнения заданий на острове.
Семя мококо в правом нижнем углу находится в тупике. Собрать его можно только появившись в этом месте при входе на уровень.

Translated above comment:

"Mokoko location points are shown in the picture. Upon entering the level, the character appears in one of 15 random points (marked with gray squares).
The blue and red dots mark the location of the NPC. Pink marks the shortest paths to complete tasks on the island.
The mococo seed in the lower right is at a dead end. You can collect it only by appearing in this place at the entrance to the level."

Also adding this:
For the "dead end mokoko", you have a 1/15 chance of spawning in the correct place. This means that the chances are:
- 52% at 12 tries
- 75% at 23 tries
- 90% at 38 tries
- 99% at 75 tries

Yes, i did the maths while waiting in-between Songs of Escape.

Knapp nach 15-20 Versuchen bin ich dann endlich in den Dead End Bereich gekommen.